La asociación Pasaje Begoña participa en muy diversas plataformas, equipos y redes de trabajo. Destaca la participación de la Asociación Pasaje Begoña en las actividades de la Coalición internacional «Sites os Conscience». Por otro lado, destaca la constante colaboración de la Asociación Pasaje Begoña con las redes ILGA, EPOA e INTERPRIDE y la participación en la Red EAPN para la cooperación con el resto de entidades sociales que representan a colectivos en situación o riesgo de exclusión social.
Logotipos de las entidades EAPN, EPOA e INTERPRIDE.
Destaca la participación de la Asociación Pasaje Begoña en el equipo de trabajo con la Policía Nacional para prevenir, identificar y actuar sobre los delitos de odio. Este servicio está a disposición quiénes visitan el Pasaje Begoña para la promoción de la seguridad y la prevención del delito.